Sept établissements privés assurent l’enseignement pré-élémentaire et primaire dans la région :
- L'école Saint-Vincent à Ferney-Voltaire
- L'école Les Petits Polyglottes in Ferney-Voltaire
- L'école Jeanne d'Arc à Gex
- L'école Montessori bilingue - Les Tournesols à Grilly, Divonne et Chevry
- L'école Sainte-Marie à Chevry
- L'école Montessori - Mont et sourire à Saint-Jean-de-Gonville
- L'école Alternative Du Pays De Gex à Prévessin-Moëns
Au niveau de l’enseignement secondaire de premier cycle, seul le Collège Jeanne d'Arc à Gex est une institution privée.
Le Lycée polyvalent Jeanne d'Arc (professionnel et général) à Gex offre la possibilité de suivre des études secondaires de second cycle et permet d’obtenir un baccalauréat professionnel dans les domaines suivants :
- Services administratifs
- Exploitation des transports
- Commerce
- Vente
- Logistique
Ces établissements privés assurent tous l'enseignement du programme officiel français.
La scolarité est payante. Les tarifs varient selon l’établissement considéré.